一名位于底层的消防队员被一名从天而降的跳楼者砸死。
由于烟雾与上升气流太过浓烈，空中救援活动无法进行，而且纽约市本身就缺乏专门进行空中救援的直升机。
九点钟，美国联邦航空管理局波士顿空中交通控制中心发布命令，暂停其管辖区内所有飞机的起飞。紧接着，美国联邦航空管理局禁止任何飞机进入纽约以及附近的波士顿、克利夫兰与华盛顿领空。
两分钟后，美国联邦航空管理局禁止全美国所有飞往或经过纽约领空的飞机起飞，纽约市全部隧道及大桥关闭。
九点二十四分，正在佛罗里达州一所小学教室参观的美国总统乔治.布什接到第二架飞机撞击世贸大楼的消息，他在该堂课结束后立即在学校的另一个教室发布了一段简短的讲话称，美国正遭到恐怖分子袭击，美国政斧将对飞机失事原因展开全面调查，另外他称事件是国家的悲剧。
与此同时，FAA通知NORAD东北空防部门，美国航空公司七十七次航班已经被劫持，他们连线讨论美国航空公司七十七次航班与联合航空公司九十三次航班的有关事宜。随后，美国联邦航空管理局宣布禁止全国所有民航班机起飞。
上午九点三十七分，美国航空公司七十七次航班，一架波音757飞机，撞入五角大楼西翼并且引起大火。被袭击的部分刚刚翻新过，还没有完全投入使用，但是仍然造成五角大厦西翼百余人丧命。
上午九点四十五分，美国关闭其领空，禁止任何民航班机起飞，所有在飞行的班机必须立即在距离最近的机场降落，所有飞往美国的航班即刻改飞加拿大。
之后，FAA宣布禁飞，其间只有军事及救援飞机被允许起飞，这次是美国历史上第四次停止所有在美商业航班的运作，并且是唯一的一次未经计划的紧急措施，在此之前都是因国防需要而停飞所有飞机。
美国白宫与美国国会山关闭，周围地段戒严，总统布什离开佛罗里达州。
上午九点五十九分零四秒，世界贸易中心南楼倒塌。通过电视台的现场直播，全球亿万观众目睹了大楼的坍塌。
十点零三分，联合航空公司九十三次班机在宾西法尼亚州尚克斯维尔东南部坠毁。警方调查报告表明，机上无人生还。后来的进一步调查显示，飞机坠毁前有旅客通过移动电话与地面取得过联系，并且已经得知世界贸易中心与五角大楼遭到袭击。
在得知自身即将成为自杀炸弹后，至少有三名乘客冒险奋勇还击，试图从劫机者手中重夺飞机控制权，很有可能是由于激烈的反抗导致飞机在未到达目的地前便坠毁。
白宫、财政部、国务院及其它主要政斧机构内的人员开始撤离，五角大楼部分地区坍塌。纽约联合国总部开始进行疏散，上万人受影响。
十点二十八分零一秒，世界贸易中心北楼从上到下坍塌，在撞击点以上的楼层无人生还。
北楼之所以要比南楼晚倒塌，主要有三个原因：撞击点较高、飞机速度较慢，受影响楼层的防火系统已经被部分更新；位于双塔附近的万豪酒店、美国海关、希尔顿酒店等建筑也遭到破坏。
上午十点三十九分，美国总统布什发布命令，在紧急情况下，空军可以击落任何有可能进行袭击的飞机。
CNN报导华盛顿与纽约市已经开始进行全面疏散工作，联合国总部已经清空，几分钟后，纽约市长下令疏散曼哈顿地区。
在事件[***]有两千九百九十八人罹难，共有四百一十一名救援人员在此事件中殉职。当天的恐怖袭击对美国及全球产生巨大的影响，这次事件是继第二次世界大战期间珍珠港事件后，历史上第二次对美国造成重大伤亡的袭击。
这次事件也是人类历史上迄今为止最严重的恐怖袭击事件，美国政斧对此次事件的谴责和立场也受到大多数国家同情与支持，全球各地在事件后都有各种悼念活动，事发现场的清理工作持续到次年的年中。
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