这时在潼关中，孙传庭的残部只有一万余人，而且全军的士气低落，朝廷答应拔调的兵员又迟迟未到。潼关虽有天险，但也万难守住。首先是高杰和白广恩被李自成击败溃逃，潼关也随即失守。孙传庭率领残兵，退守到了渭南，企图继续固守，而李自成也毫不放松，率军继续追击，渭南城破，孙传庭当场阵亡。白广恩、陈永福先后投降李自成。
而孙传庭的另一员部将高杰，因为当初他诱拐了李自成的妻子，给李自成戴了顶绿帽子，因此自知是投降必死，于是先从潼关退回陕北，招集孙传庭的余部，然后南逃淮西地区，后来被凤阳总督马士英收为己部。而李自成却率领大军，进攻西安。
等到这个消息又传到北京之后，朝中还在为调吴甡北上还是吴三桂南下的事情而争吵不休，这一下次满朝无语，就连崇祯也傻了。原来他们都以为孙传庭虽然在郏县大败，但守住潼关还是可以的，那样局势还不算太糟，却没有想到这回连潼关也失守了。
不过虽然上报孙传庭战死，但尸体始终还没有找死，因此崇祯还抱以一丝侥幸心里，认为孙传庭或许没死，还会收拾人马，整军再战，于是崇祯下令对孙传庭不予赠荫、哀悼。一直到十一月，这个消息才最终证实，崇祯也不禁悲痛之极。但又耽误了一个多月的时间。
而崇祯又迁怒于首辅陈演，将郏县惨败所有过失都推到陈演身上，下旨将他革职，改由魏藻徳出任首辅。这时又有大臣提议，调吴三桂或吴甡救应。崇祯虽然也同意调其中一人，但并未言明调谁，而是令魏藻徳率内阁决意。有陈演的前车之鉴，魏藻德那里还敢决议，议了几天之后，反而向崇祯建议，派人赴关外、南京两地，当面询问吴三桂和吴甡的意见，然后再做决议。崇祯也下旨照办。
在此期间，崇祯又任命兵部待郎余应桂出任陕西总督。又下令宣大总督、山西巡抚协剿这个时候余应桂那里还敢到陕西去上任，脸如土色，推托不往。而宣大总督、山西巡抚也都避之不及，都推说饷乏马缺，不肯应承。
时间就这样也一天天的过去，大明朝的气数将尽了。