而且这一招清廷也同样不能反用于南京，因为南京政府的统治，是建立在稳定的民众支持基础上，商毅、政府和中华军在民众之中也有非常高的威信力，而且现在也并没有尖锐的对立矛盾，因此也可以说，想在南京政府的统治区內，煽动百姓起来聚众闹事作乱，根本就是不可能的事情。
另一方面，虽然多尔衮心里明知，这次暴乱的背后，有南京政府的谍报人员在指挥、组织，并且也派人进行严密的监查，但一连过去了五六天的时间，据然一点线索都没有发现，这也让多尔衮觉得郁闷不己。为什么清廷的间谍在南京搞了一点事情，就立刻被南京方面全都揪出来了呢？
其实这也是有两方面的原因，一是发生大动乱，本身就可以浑水摸鱼，掩盖住许多线索。另一方面，这一场动乱，是经过了南京方面精心的策划、安排、组织，商毅甚致为此还推迟了出发去马尼拉的时间，整个过程、每一个环节都进行了反复的研究，以确保万无一失；同时所有亲身参与这一场动乱的人员都在事先和情报网络分离，并有各种其他身份掩护，而在完成任务之后，参与的人员也将立刻全部撤回南方，不会给清廷留下任何线索；而且南京建立的谍报糸统，也远比清廷的严密，绝大部份人员都是单线联系，因此就算被清廷抓住一两个人，也不会对整个北京的情报网络造成太大的损失。
时间一天天过去，转眼就到了顺治五年(1648年) 的腊月三十，新年来临，而满汉对立的情绪不仅没有缓解，还有愈演愈烈的发展驱势，多尔衮也意识到，事情再也不能拖下去了，必须拿出一个解决的办法来。