看似简单的一个举动，事实上是给予天下人一个信号。他曹操要正式代天子，管治天下，而复设丞相是给他个名正言顺的机会而已，毕竟这有先例。
曹操此举用意，明眼人一看就清楚，故而此言一出，当即遭到一众拥汉大臣反对，其中闹得最凶的乃是孔融。此时的孔融，在董承见杀之后，已经逐渐成为拥汉派的领袖。特别是杨彪因为跟袁术有姻亲关系，袁术死后，曹操就曾想杀杨彪，最后还是在荀彧的劝说下免了。但杨彪也清楚自己的处境，故而平日都不多见客，深居简出，上朝也是和稀泥。
孔融的反对没有让曹操太意外，而借此机会曹操大发雷霆，让人将孔融拿下，并要治他的罪。出头的人被拿，众人也无奈只能赞同曹操之议，这天曹操是威势尽显，即便天子也不敢多言。
不过事后，荀彧就曾去劝曹操，不要杀孔融。然曹操心意已决，哪里会听，这让荀彧无奈而去。
曹操行动极为迅速，让人草拟了孔融的罪状之后公布出来，随后更是要灭他全族。消息一出，天下震惊，荀彧再次赶去阻止，不过都是无用。
而公布了罪状之后，曹操立即展开行动，派人缉拿孔融全家，并将他们下狱。让人不解的是，曹操没有用许褚、典韦这两个心腹亲信去，反而让曹丕负责缉拿！